Frequência de TP53 na modulação do microambiente tumoral e progressão do câncer da próstata (2023)
- Authors:
- Autor USP: SILVA, FRANCISCO CESAR DE SOUSA E - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RCA
- DOI: 10.11606/D.17.2023.tde-10112023-155700
- Subjects: NEOPLASIAS DOS GENITAIS MASCULINOS; PROGNÓSTICO; METÁSTASE NEOPLÁSICA
- Keywords: Câncer de próstata; Microambiente tumoral; Progressão; Progression; Prostate cancer; TP53; Tumor microenvironment
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Sabe-se que a perda ou mutação do TP53 no câncer promove a progressão do tumor. No entanto, o papel do TP53 mutado nos tumores primários do câncer da próstata (do inglês, Prostate Cancer, PCa) continua a ser pouco conhecido. Embora se acreditasse inicialmente que as mutações do TP53 ocorriam tardiamente na doença e se correlacionavam com metástases e resistência à terapêutica de castração, estudos recentes demonstraram uma inativação inesperadamente frequente do TP53 no PCa primário. No entanto, existem poucos dados sobre a forma como as alterações na expressão do gene TP53 de tipo selvagem nas fases iniciais da doença podem influenciar a progressão do tumor e o impacto no microambiente do PCa. Neste estudo, o nosso objetivo foi investigar os efeitos de níveis reduzidos e aumentados de expressão do RNA TP53 em genes diferencialmente expressos (DEGs) e vias a jusante associadas à progressão tumoral. Utilizamos uma coorte retrospectiva de 51 doentes com PCa de risco intermédio do nosso instituto (FMRP). O RNA extraído de amostras de tumor fixadas em formalina e embebidas em parafina foi analisado utilizando o painel Nanostring PanCancer, que inclui 730 genes de vias relacionadas com a progressão do tumor. Efetuamos análises de expressão diferencial e de enriquecimento de vias, comparando parâmetros clínicos de doentes com DEGs de interesse e classificando a expressão de RNA tumoral em níveis elevados e baixos de TP53. Nossos achados revelaram vários DEGs down regulados associados à alta expressão de TP53, incluindo três genes da via WNT (WNT10A, WNT7A e WNT6) e cinco genes da via FGF (FGF4, FGE21, FGF23, FGF14 e FGF22). Além disso, observamos a up regulação de DEGs como POLB, PLA1, E2F5, IL20RA e NOL7 com elevada expressão de TP53. A análise de enriquecimento identificou as vias Wnt-beta Catenin, KRAS, sistema imunitário complementar, PI3K/AKT/mTOR ereparação do DNA como estando associadas a níveis de expressão de TP53 alterados. Para validar os nossos resultados, realizamos análises TCGA, que demonstraram a down regulação de genes da família WNT (WNT6 e WNT10A) em tumores de PCa com níveis elevados de expressão de TP53, o que é consistente com os nossos resultados Nanostring utilizando a coorte FMRP. A nossa análise destaca vários DEGs associados à expressão de TP53 que desempenham papéis distintos na progressão do tumor e na resposta imunitária. Muitos destes DEGs foram previamente descritos como potenciais biomarcadores de prognóstico ou foram associados a alterações no microambiente tumoral do PCa. De um modo geral, os nossos resultados sublinham a importância de compreender como as perturbações nos níveis de expressão do TP53 podem influenciar as vias de progressão no PCa. Este conhecimento poderá contribuir para a identificação de novos alvos terapêuticos e para o desenvolvimento de melhores marcadores de prognóstico para os doentes com PCa
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- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2023
- Data da defesa: 23.08.2023
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- Cor do Acesso Aberto: gold
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ABNT
SILVA, Francisco Cesar de Sousa e. Frequência de TP53 na modulação do microambiente tumoral e progressão do câncer da próstata. 2023. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17137/tde-10112023-155700/. Acesso em: 23 maio 2024. -
APA
Silva, F. C. de S. e. (2023). Frequência de TP53 na modulação do microambiente tumoral e progressão do câncer da próstata (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17137/tde-10112023-155700/ -
NLM
Silva FC de S e. Frequência de TP53 na modulação do microambiente tumoral e progressão do câncer da próstata [Internet]. 2023 ;[citado 2024 maio 23 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17137/tde-10112023-155700/ -
Vancouver
Silva FC de S e. Frequência de TP53 na modulação do microambiente tumoral e progressão do câncer da próstata [Internet]. 2023 ;[citado 2024 maio 23 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17137/tde-10112023-155700/ - Interactions between PTEN, TP53, RB1 and TMPRSS2-ERG genes in prostate cancer progression
- Differential gene expression related to TMPRSS2-ERG fusion, CDK12, RB1, TP53, AR and ZEB1 based on transcriptomic analysis of the TCGA PRAD cohort
- Analysis of the impact of ZEB1 expression on pathway enrichment and immune cell abundance in prostate cancer
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.17.2023.tde-10112023-155700 (Fonte: oaDOI API)
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