Application of genotype-by-sequencing for diversity and genetic marker identification of hop cultivars in Brazil (2022)
- Authors:
- Autor USP: BURRICKS, ASHLEY NOEL - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- DOI: 10.11606/D.11.2022.tde-15092022-153546
- Subjects: DIVERSIDADE GENÉTICA; GENÉTICA DE POPULAÇÕES VEGETAIS; GENÔMICA; LÚPULO; MARCADOR MOLECULAR; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; VARIEDADES VEGETAIS
- Keywords: Genotipagem por sequenciamento
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: Humulus lupulus é uma planta originalmente cultivada na Europa para produção de cones, que são utilizados na fabricação de cerveja. O Brasil tem uma grande indústria cervejeira, mas o cultivo do lúpulo tem sido limitado devido às condições climáticas inadequadas para a cultura. Um programa de melhoramento de lúpulo no Brasil é necessário para o desenvolvimento de cultivares adaptadas ao clima e rentáveis para o produtor rural. Para construir uma base sólida para os programas de melhoramento é necessária uma compreensão mais profunda do germoplasma disponível. Objetivou-se no estudo suprir essa necessidade utilizando o método de genotipagem por sequenciamento (GBS, em inglês) para ampliar a compreensão da diversidade genética de lúpulo disponível no Brasil, assim como desenvolver meios discernir com precisão a identificação de cultivares. Para isso, primeiramente foi identificado que o genoma de referência da cultivar Cascade e o chamador de variantes bcf tools como os mais adequados para os dados deste trabalho. Em seguida, 5971 SNPs de alta qualidade foram utilizados para distinguir duas populações. Foram encontrados quatro marcadores SSR, mas a análise não confirmou a eficiência do seu uso para identificação de cultivares. Tanto para a análise de marcadores quanto para o estudo de diversidade está claro que existiram erros de identificação de cultivares de lúpulo no Brasil, entretanto, não foi possível seu uso para identificação das cultivares nesse estudo
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2022
- Data da defesa: 01.07.2022
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
- URL de acesso aberto
- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
-
ABNT
BURRICKS, Ashley Noel. Application of genotype-by-sequencing for diversity and genetic marker identification of hop cultivars in Brazil. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-15092022-153546/. Acesso em: 06 jun. 2024. -
APA
Burricks, A. N. (2022). Application of genotype-by-sequencing for diversity and genetic marker identification of hop cultivars in Brazil (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-15092022-153546/ -
NLM
Burricks AN. Application of genotype-by-sequencing for diversity and genetic marker identification of hop cultivars in Brazil [Internet]. 2022 ;[citado 2024 jun. 06 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-15092022-153546/ -
Vancouver
Burricks AN. Application of genotype-by-sequencing for diversity and genetic marker identification of hop cultivars in Brazil [Internet]. 2022 ;[citado 2024 jun. 06 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-15092022-153546/
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.11.2022.tde-15092022-153546 (Fonte: oaDOI API)
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
