Modelos genômicos não aditivos na avaliação de vacas leiteiras (2021)
- Authors:
- Autor USP: PILONETTO, FABRICIO - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LZT
- DOI: 10.11606/T.11.2021.tde-10112021-182732
- Subjects: GENÔMICA; VACAS; BOVINOS LEITEIROS; HETEROSE; VARIAÇÃO GENÉTICA; FENÓTIPOS; MARCADOR MOLECULAR
- Keywords: GEBV; Heterozigosidade
- Language: Português
- Abstract: Na pecuária leiteira, o interesse em selecionar animais com alto potencial genético para produção e qualidade do leite, pode causar um decréscimo na variabilidade genotípica, devido à intensa pressão de seleção. Neste contexto, as avaliações genéticas têm considerado apenas os efeitos genéticos aditivos, não sendo incluídos efeitos de dominância nos modelos de predição, por exemplo. O objetivo deste trabalho foi verificar a contribuição dos efeitos genéticos não-aditivos nos modelos de predição genômica e inferir a heterozigose molecular e a heterose genômica. Foram testadas a habilidade e o viés na predição dos valores genéticos genômicos (GEBVs) por um modelo puramente aditivo e outro aditivo-dominante. Estes foram comparados e as estimativas de variância computadas e avaliadas de acordo com o modelo proposto. Uma segunda fase compreendeu estimar a heterozigosidade e a heterose genômica, e realizar uma adaptação da associação ampla do genoma (GWAS) para capturar as variâncias não-aditivas, identificar regiões do genoma com possível vantagem heterozigótica e de marcadores moleculares associados ao fenótipo. Em ambas as fases foram utilizados dados simulados e registros fenotípicos reais de bovinos leiteiros da raça Holandesa. As proporções da variância de dominância em relação ao fenótipo foram de 2,9 a 5,2% em dados simulados, e de 0,08 a 3,8% para as características produção e qualidade do leite. A maior acurácia foi de 0,79 e 0,36 no modelo aditivo e aditivo-dominantesimulado, respectivamente. Para os dados reais, as estimativas foram semelhantes entre os modelos. O melhor desempenho do modelo foi para gordura e ácido graxo, com maior vantagem para ácido graxo quando incluído os efeitos de dominância na avaliação. Em média, para o cenário de menor herdabilidade (h2 = 0,10), a taxa de heterozigosidade foi de 35,6%, e níveis próximos foram encontrados para os demais cenários (35,4 e 35,7%). O cenário de maior herdabilidade apresentou os maiores valores médios de heterose genômica (17,0%), comparado aos demais (3,02 a 11,0%). Os coeficientes de regressão revelaram que a heterozigosidade tem impacto positivo sobre a heterose genômica para a maioria das populações simuladas. A heterozigosidade avaliada de forma empírica e por meio de dados reais revelou resultados otimistas quanto à possibilidade de selecionar os animais de raça pura, para gerar maior e melhor heterose genômica. Incluir os efeitos de dominância no modelo de GWAS adaptado pode contribuir para a identificação de marcadores associados ao fenótipo, de forma semelhante ou superior ao modelo aditivo adaptado. Conclui-se que incluir os efeitos de dominância deve beneficiar uma melhor estimativa dos componentes de variância genética, principalmente para as características de menor herdabilidade e altamente influenciadas pelo ambiente. Além disso, sugere-se que a heterose genômica em populações de raça pura pode ser acessada se considerado os fatores de heterozigosidade molecular esuas associações com o fenótipo de interesse
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2021
- Data da defesa: 29.09.2021
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
- URL de acesso aberto
- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
-
ABNT
PILONETTO, Fabricio. Modelos genômicos não aditivos na avaliação de vacas leiteiras. 2021. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2021. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-10112021-182732/. Acesso em: 20 maio 2024. -
APA
Pilonetto, F. (2021). Modelos genômicos não aditivos na avaliação de vacas leiteiras (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-10112021-182732/ -
NLM
Pilonetto F. Modelos genômicos não aditivos na avaliação de vacas leiteiras [Internet]. 2021 ;[citado 2024 maio 20 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-10112021-182732/ -
Vancouver
Pilonetto F. Modelos genômicos não aditivos na avaliação de vacas leiteiras [Internet]. 2021 ;[citado 2024 maio 20 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-10112021-182732/ - Genetic parameters for milk yield, casein percentage, subclinical mastitis incidence and sexual precocity using Bayesian linear and threshold models
- Random-effect meta-analysis of genetic parameter estimates for carcass and meat quality traits in beef cattle
- Adaptive, morphometric and productive responses of Brazilian hair lambs: crossing between indigenous breeds - A machine learning approac
- Associações genéticas entre características de interesse econômico e identificação de haplótipos para doenças genéticas em vacas da raça Holandesa criadas no Brasil
- Genetic effects of heat stress on milk fatty acids in Brazilian Holstein cattle
- Estimation of breeding values using different densities of SNP to inform kinship in broiler chickens
- Genetic effects of heat stress on milk fatty acids in a Brazilian Holstein cattle
- CNV detection and their association with growth, efficiency and carcass traits in Santa Inês sheep
Informações sobre o DOI: 10.11606/T.11.2021.tde-10112021-182732 (Fonte: oaDOI API)
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
